Дани Педроса с Хонда спечели Гран При на Япония, докато действащият световен шампион Хорхе Лоренсо остана втори. Трети се нареди Кейси Стоунър, който направи грешка в началните обиколки.

Стоунър обаче води с 40 точки на пилота на Ямаха Лоренсо във временното класиране. Педроса стигна до успеха по-скоро с късмет, тъй като инцидентите доминираха на пистата "Мотеги".

Валентино Роси бе първата жертва, той направи контакт с Лоренсo на завой 2 в началото и отпадна от състезанието, завличайки и Бен Спийс с Ямаха. Ники Хейдън и Алваро Баутиста също напуснаха състезанието заради катастрофи.