ДВУБОЙ ПЪРВИ МАЧ РЕВАНШ
ВИКИНГУР (Фар) – Интер (Турку, Фин)
 1:1 1:0
ЖАЛГИРИС (Лит) – Сейнт Патрикс (Ейре)
 2:2  2:1
Броутън (Уелс) – ВЕНТСПИЛС (Лат)
 1:1 0:0
Транс Нарва (Ест) – ЙЕФЛЕ (Шв)
 0:3 1:5
КР (Исл) – Гленторан (СИрл)
 0:0  3:0
ЧИХУРА (Гру) – Вадуц (Лих)
 0:0 1:1
МИЛСАМИ (Мол) – Дюделанж (Люкс)
 1:0 0:0
Металург (Скопие, Мак) – КАРАБАХ (Азер)
 0:1 0:1
Видеотон (Унг) - МЛАДОСТ (Чгора)
 2:1 0:1
Флора (Талин, Ест) – КУКЕСИ (Алб)
 1:1 0:0
Тетекс (Мак) – ПЮНИК (Арм)
 1:4 0:1
Теута (Алб) – ДАЧИЯ (Мол)
 3:1 0:2
СAРАЕВО (БиХ) - Либертас (Сан Марино)
 1:0  2:1
Слиема Уондърърс (Мал) – ХАЗАР (Азер)
 1:1 0:1
Левски (Бъл) – ИРТИШ (Павлодар (Каз)
 0:0 0:2
Хибъриънс (Мал) – ВОЙВОДИНА (Сър)
 1:4  2:3
Астана (Каз) - "БОТЕВ" (Пловдив, Бъл)
 0:1 0:5
Санта Колома (Анд) – ЖРИНСКИ (БиХ)
 1:3 0:1
Домжале (Слвн) – АСТРА (Плоещ, Рум)
 0:1 0:2
РУДАР (Чгора) – Мика (Арм)
 1:0 1:1
БРЕЙДАБЛИК (Исл) - ФК Санта Колома (Анд)
 4:0 0:0
Дроида (Ейре) – МАЛМьО (Шв)
 0:0 0:2
ИФК Мариахамн (Фин) – ИНТЕР (Баку, Азер)
 1:1 0:2
Фуглафьолдур (Фар) – ЛИНФИЙЛД (СИрл)
 0:2 0:3
Престатин Таун (Уелс) – МЕТАЛУРГС ЛИЕПАЯ (Лат)
 1:2 3:4 сл.д.
Целие (Слвн) – ТРОМСО (Нор)
 1:2 0:2
Тираспол (Мол) – СКОНТО (Лат)
 0:1  3:4 сл. д.
Крусейдърс (СИрл) – РОЗЕНБОРГ (Нор)
 1:2 2:7
Торсхавн (Фар) - ИВБ (Исл)
 1:1 0:1
ЖЮНЕС ЕШ (Люкс) – ТПС Турку (Фин)
 2:0 1:2
Бала Таун (Уелс) – ЛЕВАДИЯ (Ест)
 1:0 1:3
Круожа (Лит) – ДИНАМО (Минск, Блрс)
 0:3 1:5
Ла Фиорита (Смар) – ВАЛЕТА (Мал)
 0:3 0:1
Лачи (Алб) – ДИФЕРДАНЖ (Люкс)
 0:1 1:2
Гандзасар (Арм) – АКТОБЕ (Каз)
 1:2 1:2
Челик (Чгора) – ХОНВЕД (Унг)
 1:4 0:9
Торпедо (Кутаиси, Гру) – ЖИЛИНА (Слвк)
 0:3 3:3
Судува (Лит) - ТУРНОВО (Мак)
 2:2 4:5 сл. д.

Заб.: Първите мачове са на 4 юли, а реваншите на 11 юли 2013 г. На първо място е посочен отборът, който е домакин в първата среща. Отборът, отбелязан с по-дебел шрифт се класира за следващата фаза.